Küçük Medrese, Lefkoşa'da yer alan, günümüzde tamamen yıkılmış bulunan bir medrese. Konumu Selimiye Meydanı'nın kuzeyinde, Kadı Menteş Konağı ile Küçük Medrese Sokak arasındaydı. 1579-80 (Hicri 987) yılında inşa edilmiştir.
Küçük Medrese'den sorumlu olan vakfın ilk kurucusunun kim olduğu bilinmemektedir. Tuncer Bağışkan'ın aktarımına göre literatürde ilk kurucunun Lala Mustafa Paşa olduğu öne sürülmektedir. 1 Nisan 1642'de Kıbrıs eski müftüsü Saadettin Efendizade Ahmet Efendi'nin kurduğu "Ahmet Efendi ibn-ı Saadeddin Efendi Vakfı", Neyzen Çiftliği'nden elde ettiği gelirle medresenin tamir ve ıslahını, müderrise günde on akçe, on fakir öğrenciye günde üçer akçe verilmesini üstlenmiştir. Kıbrıs Vakıflar İdaresi muhasebecisi Fahri Efendi'nin 25 Mart 1912 tarihli raporuna göre bu düzenleme hâlen geçerliliğini korumakta ve müderris Abohorlu Ahmet Efendi'ye yılda 720 kuruş verilmekte olsa da medresede normal süreli bir eğitim devam ettirilememekte ve dolayısıyla vakıf koşulları tam olarak karşılanamamaktaydı.
Ali Ruhi Efendi Çeşmesi adı altında bir çeşmesi ve bu çeşmenin 1828 (Hicri 1244) tarihli yazıtı günümüze tek ulaşan kısmıdır.
