Gökdere, Amasya ilinin Merkez ilçesine bağlı bir köydür.
Gökdere Köyü'nün yerleşim tarihi tam olarak bilinmemesine rağmen köy büyüklerinin anlattıkları rivayetlere ve Osmanlı Devleti'nin son yüzyılında yaşadığı sürece bakıldığında, köyümüzün Osmanlı-Rus savaşları döneminde özellikle Kars, Ardahan, Erzincan, Erzurum ve Malatya yöresinden gelen göçebe aşiretler tarafından kurulduğu varsayımı ağırlık kazanmaktadır.
Gökdere Köyü'nün yerleşim tarihi tam olarak bilinmemesine rağmen köy büyüklerinin anlattıkları rivayetlere ve Osmanlı Devleti'nin son yüzyılında yaşadığı sürece bakıldığında, köyümüzün Osmanlı-Rus savaşları döneminde özellikle Kars, Ardahan, Erzincan, Erzurum ve Malatya yöresinden gelen göçebe aşiretler tarafından kurulduğu varsayımı ağırlık kazanmaktadır.