Tokyo Tıp Üniversitesi, Japonya'nın başkenti Tokyo'da bulunan bir tıp vakıf üniversitesidir. Üniversite, 1916 yılında bir tıp okulu olarak kurulmuş olup 1946'da üniversite haline geldi.
Tokyo Tıp Üniversitesi, tıp eğitimi politikasına uygun olarak, tıp öğrencilerinin ulusal tıp lisanslama sınavına girmeye hak kazandığı bir lisans veya yüksek lisans derecesi vermek için 'klinik öncesi' ve 'klinik' çalışmalar sunan altı yıllık bir tıp fakültesi müfredatına sahiptir. Üniversitenin ayrıca doktora dereceleri sunan bir yüksek lisans okulu bulunmaktadır.
Üniversiteye bağlı üçüncü basamak eğitim hastaneleri arasında Tokyo Tıp Üniversitesi Hastanesi bulunmaktadır. 1931'de kurulan hastane, Nishi Shinjuku'da yer almaktadır ve 1.091 yatak kapasitesine ve yaklaşık 1.800 tıbbi personele sahiptir.
